鸡肠毒综合症是由球虫、梭菌等其他病原菌混合感染引起的以肠道菌群失调，鸡肠毒综合症临床上以拉稀为主要特征的综合性疾病。鸡肠毒综合症在气候变化异常、昼夜温差大的季节易发。肉鸡、蛋鸡均可发鸡肠毒综合症，一般在炎热潮湿的夏季多发，复发性高，同时鸡肠毒综合症可引起免疫抑制。

鸡肠毒综合症初期，鸡群一般没有**症状，精神正常，食欲正常，不出现伤亡。仅是个别鸡出现排稀薄、不成形，内含没有消化的饲料的粪便。鸡肠毒综合症此期持续时间较长，可达20-30天。随着时间的延长，整个鸡群开始腹泻，甚至发生水泻，粪便变得更稀薄，不成形、不成堆，比正常粪便所占面积大，粪便中含有更多未消化的饲料，呈浅黄色或淡绿色，有时可见西红柿或鱼肠样粪便，此时鸡群采食量开始下降。在鸡肠毒综合症的后期，粪便特别稀，内混红褐色物，此期易出现有神经症状的病死鸡，一般呈零星伤亡。

鸡肠毒综合症初期，十二指肠、空肠的卵黄蒂之前的部分肠黏膜增厚，颜色变浅，呈灰白色，似一层厚厚的皱皮，极易剥离，内含大量脓性黏液；鸡肠毒综合症的中后期，肠管外观黑紫色，常增粗3-5倍，剪开肠管内容物完全呈红褐色，用剪子刮肠黏膜，其上被覆的一层褐色糠麸样物质完全脱落，只剩下一层薄膜。其他脏器无**病变。